Bolsas disponíveis no LBMAD
Título do cargo: Bolsista de pós-doutorado
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Instituição: Universidade de São Paulo, São Paulo, Brasil
Departamento Acadêmico: Faculdade de Ciências Farmacêuticas - Universidade de São Paulo
Especialidades Disciplinares de Pesquisa
• Biologia Estrutural Computacional
• Modelagem Molecular
Descrição do cargo
O laboratório Hirata da Faculdade de Ciências Farmacêuticas está em busca de um pós-doutorando interessado em seguir carreira na interface entre as ciências computacionais e experimentais. Este bolsista liderará um projeto de modelagem estrutural computacional e desenho molecular de novos medicamentos para o tratamento de doenças cardíacas.
O gene PCSK9 codifica proteínas que participam do processo de endocitose do colesterol, controlando a reciclagem do receptor de LDL, e é responsável por até 2% dos casos de IC devido a uma variante de ganho de função, que causa maior destruição do receptor de LDL e consequentemente aumento de plasma LDL. Essa proteína desempenha um papel fundamental no metabolismo do colesterol, portanto, estudos de modelagem molecular em larga escala podem avaliar compostos que podem bloquear a atividade dessas proteínas e podem trazer perspectivas inovadoras para novos tratamentos.
O acadêmico irá dominar e aplicar abordagens in silico, como modelagem de homologia, docking de proteínas, triagem de ligantes virtuais, quiminformática e dinâmica molecular. Este trabalho envolve uma estreita colaboração com experimentalistas que trabalham no campo da biologia estrutural PCSK9. Além de realizar experimentos computacionais, o bolsista de pós-doutorado deve fazer apresentações regulares em reuniões internas e estendidas do grupo e escrever artigos sob a orientação do mentor. Eles trabalharão com o mentor para garantir bolsas e, eventualmente, se candidatarão a prêmios de carreira no caminho para obter independência científica.
Qualificações requeridas
• Doutorado em Ciências Biológicas ou afins, com interesse em aprender e aplicar abordagens computacionais a problemas biomédicos.
Alternativamente, PhD em Computer / Data Science ou um campo relacionado, e um interesse em ensaios cinéticos e farmacologia.
• Compromisso com a qualidade, rigor, transparência e reprodutibilidade na pesquisa científica.
• Familiaridade básica com o processo de script de computador e uma linguagem de script como Shell e Python.
• Publicações do primeiro autor do período de treinamento anterior.
• Compromisso com a equidade, diversidade e inclusão.
• Boas habilidades de redação e apresentação.
• Capacidade de comunicar-se pessoalmente, em plataformas de videoconferência e por e-mail.
Qualificação preferida
• Familiaridade com uma interface de computador de linha de comando
• Familiaridade com um pacote de modelagem molecular (por exemplo, Schrodinger, MOE, Sybyl X, etc.)
• Familiaridade com software de dinâmica molecular (por exemplo, GROMACS, Desmond, etc.)
• Conhecimento de um software de processamento de imagem como o Inkscape
• Familiaridade com curvas de resposta de concentração farmacológica e o software de regressão não linear, como GraphPad Prism
• Familiaridade com técnicas básicas de laboratório e instrumentação
• Experiência com ensaios farmacológicos
Local de Trabalho: São Paulo, SP.
A Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo (USP) está localizada na cidade de São Paulo - SP. A FCF-USP surgiu do desmembramento da antiga Faculdade de Farmácia e Odontologia da Universidade de São Paulo em duas unidades distintas. De acordo com o SCImago Institutions Rankings 2021 World Report (SIR World Report), a USP ocupa a 26ª (vigésima sexta posição) mundial entre as instituições internacionais de ensino e pesquisa classificadas.
Em 2018, de acordo com o Ranking Universitário por Desempenho Acadêmico (URAP), a USP continua a ser a melhor universidade ibero-americana e ocupa o trigésimo sexto lugar no mundo. Em 2015, a USP foi eleita a primeira universidade da América Latina. O THE classificou a instituição como a 10ª melhor universidade do BRICS e de outros países em desenvolvimento em 2015. De acordo com o QS World University Ranking 2021, a USP foi considerada a melhor universidade do mundo lusófono, à frente das suas congéneres portuguesas e africanas.
Requisitos
As inscrições devem ser enviadas diretamente para o Prof. Mário H. Hirata pelo e-mail: mhhirata@usp.br.
Prazo: 15.09.2021
Requisitos de documentos
• Curriculum vitae
• Carta de apresentação
Requisitos de referência
• Três referências profissionais (apenas informações de contato), incluindo o orientador acadêmico atual ou anterior.
Oportunidade de bolsa FAPESP
• Treinamento Técnico• Iniciação Cintífica
Maiores informações diretamente com Prof. Mário H. Hirata pelo e-mail: mhhirata@usp.br.