Sobre o LBMAD
O Laboratório de Biologia Molecular Aplicado ao Diagnóstico e Farmacogenômica - LBMAD foi estabelecido no ano de 1995. A atividade deste centro é formar especialistas em GENOMICA, EPIGENOMICA, FARMACOGENOMICA, PROTEOMICA, LIPIDOMICA E METABOLOMICA. Dentre as metodologia utilizada estão a purificação de Ácidos Nucleicos (DNA, RNA, mirRNA), sistemas de Amplificação pela Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR) convencional e qPCR. O ultrassequenciamento genomico, exomico, estudo de metilação, expressão de RNA mensageiro, RNA longo não codificante, miRNA.
A Clonagem Gênica por métodos tradicionais e pelo sistema CRISP-Cas9, técnicas de Blotting, determinação de citocinas e perfil proteomico pelo sistema Luminex podem também serem treinados neste centro. Estudos das Ômicas, de sistemas biológicos com aplicação de Inteligência Artificial com Bioinformática também podem ser treinados de forma colaborativa com outros centros colaboradores.
Bioinformática básica e aplicada para sequenciamento genômico, exômico, epigenomico e transcriptômico também são processos executados pelos pesquisadores do grupo. Os estudos de Farmacogenômica o grupo é um dos pioneiros no Brasil com uma linha de pesquisa forte em medicações associadas as doenças metabólicas e cardiovasculares.
Recentemente introduziu-se também estudos de Dinâmica Molecular, Docking Molecular e processos de avaliação de compostos candidatos a novos fármacos. Estudos com células tronco pluripotente também são utilizados para estudos de Toxicocinética de Estatinas e outros medicamentos de prevenção cardiovascular.
Testes in vitro e in vivo também são executados no Laboratório de nível de segurança biológica III (NB3), o único na FCF-USP para estudos com agentes infecciosos periculosos que exigem ambientes NB3. Treinamento em biossegurança também é um foco importante do grupo.
Coordenadores
Prof. Dr. Mário Hiroyuki Hirata
Farmacêutico-Bioquímico pela UNIFAL, especialista em Analises Clinicas pelo DACT-FCF-USP, Mestre em Farmácia- Análises Clínicas, Doutor em Ciências de Alimentos FCF-USP, Pós- Doutor pela Food and Drug Administration - FDA, foi professor visitante na Kyoto University, University Illinois, USUHS, Livre docente, e Professor Titular do Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo. Foi Consultor Cientifico do Laboratório de Investigação Molecular em Cardiologia do IDPC. Pesquisador 1 A do CNPQ.
Profa. Dra. Rosario Dominguez Crespo Hirata
Farmacêutica-Bioquímica pela FCF-USP, Mestre em Farmácia- Análises Clínicas, Doutor em Ciências de Alimentos pela FCF-USP, Pós- Doutor pela Food and Drug Administration -FDA. Foi Professora Titular do Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas da FCF-USP. Pesquisadora 1C do CNPQ.
Composição atual do Laboratório
Alunos, professores e profissionais que fazem parte da equipe do LBMAD.
Cristina Moreno Fajardo
Técnica Especializada
Gláucio Monteiro, PhD
Pós Doutorado
Raul Hernandes Bortolin, PhD
Pós Doutorado
Victor Fernandes, PhD
Pós Doutorado
Suellen Rodrigues
Aluna de Mestrado
Augusto Akira Mori
Aluno de Doutoramento
Felipe Araújo Pimenta
Aluno de Doutoramento
Priscila Justo
Aluno de Doutoramento
Renata Carolina Freitas
Aluna de Doutoramento
Vanessa Malaquias
Aluna de Doutoramento
Victor Galvão
Iniciação Científica
Glauco Ferreira
Iniciação CientíficaAtuação, Tecnologia e Atividade
Áreas de Atuação do Grupo
- Genômica, Epigenômica e Farmacogenômica em doenças metabólicas e cardiovasculares.
- Pesquisa de novos compostos hipolipemiantes, estudos toxigeneticos de fármacos.
- Mecanismos de resistência Micobacteriana, mecanismos invasivos e de patogenicidade de Mycobacterium.
Tecnologias disponíveis no LBMAD
- Metodologia em Biologia Celular e Molecular e Biossegurança.
- Sistema high Throughtput de amplificação de ácidos nucleicos.
- Serviços de UltraSequenciament
- Sistema Luminex para estudo de Proteínas e Proteoma
- Infraestrutura para estudo in vitro e in vivo com segurança biologia NB3
Atividades de Extensão Universitária
- Coordenação da Campanha de Diabetes, hipertensão e hipercolesterolemia.
- Coordenação de Campanha de Teste Rápido para diagnóstico de COVID-19.
- Assessoria e Consultoria em Biologia Celular e Molecular.
Alunos Formados
Publicações
Horas de Estudo
Premiações
Instituições Colaboradoras
Internacionais
- Faculdad de Medicina - Universidade de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Espanha.
- Centro Hospitalário da Universidade de Santiago de Compostela, Espanha.
- Departamento de Ciências Básicas- Universidad de La Frontera, Temuco, Chile.
- Brigham and Woman Hospital- Harvard Univesity- Boston, MA, USA.
- Harvard Medical School - Harvard University - Boston Children Hospital, Boston, MA, USA.
- Dept. of Internal Medicine VIII - University Hospital Tübingen- Tübingen, Germany.
Nacionais
- Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade Federal de Rio Grande do Norte, Natal.
- Hospital Beneficência Portuguesa, São Paulo
- Centro Integrado de Pesquisa – CIP - Fundação Faculdade Regional de Medicina de São José do Rio Preto.
- Laboratório de Biotecnologia – BioTech - Faculdade de Ciências Aplicadas – FCA, Universidade Estadual de Campinas – UNICAMP
- Universidade Cruzeiro do Sul
- Universidade CEUMA - São Luís - Maranhão
- Fiocruz – Rio de Janeiro
- Centro de Genoma Humano IB-USP
- Instituto de Ciências Biomédicas-USP
- Instituto de Química da USP
Linha de Pesquisa
Prof. Mário Hiroyuki Hirata
1) Desenvolvimento de tecnologia aplicada ao diagnóstico laboratorial (genômica, epigenômica e farmacogenômica)
2) Marcadores epidemiológicos e de diagnóstico laboratorial (biomarcadores de doenças metabólicas e genéticas)
3) Bases fisiopatológicas das doenças (aterosclerose, doenças cardiovasculares, infecções por Micobactérias)
Profa. Rosario Dominguez Crespo Hirata
1) Desenvolvimento de tecnologia aplicada ao diagnóstico laboratorial
Disciplinas oferecidas no LBMAD
Programa de Pós-graduação
- Biossegurança/segurança, qualidade e boas práticas de laboratório
- Estatística integrativa para ciências da saúde
- Farmacogenômica e Epigenômica
- Genética em Cardiologia
Programa de Graduação
- Biossegurança e primeiros socorros
- Fisiopatologia de doenças metabólicas e cardiovasculares
- Farmacogenômica e Epigenômica
- Bioquímica Clínica
Auxílios à pesquisa do grupo
- Auxílios à pesquisa - Em Andamento
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Auxílios à pesquisa - Concluídos
- Semiconductor sequencing aplicada à investigação de morte súbita cardíaca. - Análise do transcriptoma total de Mycobacterium tuberculosis e de macrófagos infectados com M. tuberculosis frente a compostos das classes tiossemicarbazonas e hidrazidas/hidrazonas. Estudo do transcriptoma de cepas de Mycobacterium tuberculosis em células gigantes multinucleadas ativadas por vitamina A e D utilizando sequenciamento total em alta perfomance Polimorfismos dos genes LIGHT, MMP9, LT±, LGALS2, VCAM1, ICAM1, E-selectina e NFºB podem estar associados com doença arterial coronariana Triagem de mutações em genes relacionados com resistência aos quimioterápicos em isolados clínicos de Mycobacterium tuberculosis pela PCR em tempo real com curva de dissociação de alta resolução Estudo comparativo da remodelação óssea após a disjunção da sutura palatina mediana experimental sob influência do laser de baixa potência em ratos Wistar Avaliação de polimorfismos genéticos associados ao metabolismo do ácido fólico e ao desenvolvimento facial em crianças portadoras de fendas orais no estado do RN Encontro nacional das comissões internas de biossegurança - IV ENCIBio Importancia da co-infeccao chlamydia pneumoniae na aterosclerose: modelo de aneurisma aortico humano. Construção e avaliação do micobacteriófago D29 com expressão da proteína verde fluorescente para detecção rápida de bacilos da tuberculose pulmonar Effects of pioglitazone on total pparg, ppag2, sur and kir6.2 mrna expression in peripehal blood leuckocites from individuals with type 2 diabetes mellitus Identificação molecular, quantificação e controle de antibiotecoterapia de importantes periodontopatógenos pela PCR em tempo real Estudo dos mecanismos de virulencia e patogenia de cepas resistentes e sensiveis de mycobacterium tuberculosis. Participação da Chlamydia pneumoniae e Mycoplasma pneumoniae no infarto agudo do miocárdio: possível mecanismo via TLR Transcriptoma e proteoma em sangue periférico para pesquisa de novos marcadores de doenças cardiovasculares: estudo em infarto agudo do miocárdio Evaluation of paraoxonase 1 and 2-gene polymorphism in young adults with coronary artery disease. Mutacoes no gene nat: efeito na atividade enzimatica e no perfil de resistencia a isoniazida de cepas de mycobacterium tuberculosis. Construcao de fago litico com promotor hsp70 e gene de gfp com potencial de aplicacao em testes de susceptibilidade a drogas para o genero mycobacterium ssp. Evidence of association between chlamydia pneumoniae and plaque inflammation. Estudo da frequencia de haplotipos da regiao hipervariavel do dna mitocondrial em individuos caucasoides e negroides da populacao brasileira para estudo forense. Rastreamento molecular do gene do human peroxisome proliferator activated receptor gamma em pacientes com diabetes melito do tipo 02. Association of ace, apob, apoe genes polymorphism with hypertension and serum lipids in afro-brazilian individuals with high risk for coronary artery disease. Análise de mutações em genes relacionados com resistência a isoniazida em cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas em São Paulo - Brasil Robert Cannon Cooksey | Center for Disease Control and Prevention - Estados Unidos Avaliacao biologica de 3 fragmentos polipeptidicos do receptor de alfa interferon humano, dominio extra celular.
- Bolsas no País - Em Andamento
-
Bolsas no País - Concluídas
Elaboração de bibliotecas para o sequenciamento de alto rendimento e análises primárias de dados Proposta de medicina personalizada utilizando perfil farmacogenético em pacientes idosos usuários de varfarina Padronização das condições de amplificação e sequenciamento para a análise de metilação dos genes LDLr, PCSK9 e LDLRAP1 Análise integrativa do perfil de expressão de miRNAs-mRNAs obtidos a partir de banco de dados públicos de microarranjos de DNA: influência da Pregnenolona nas atividades das lipoproteínas Padronização da extração de miRNA circulantes do plasma de pacientes com Hipercolesterolemia Familial Elaboração de bibliotecas para o sequenciamento de alto rendimento e análises primárias dos dados Toxicogenética das estatinas através de células tronco pluripotentes transformadas de portadores de hipercolesterolemia familial Caracterização funcional in silico e in vitro de variantes no gene PCSK9 identificadas em pacientes com hipercolesterolemia Familial Avaliação do perfil de microRNAs exossomais em portadores de Hipercolesterolemia Familial Detecção de mutações em Mycobacterium tuberculosis resistentes a rifampicina pela PCR: quantitativo em tempo real seguida de curva de dissociação de DNA de alta resolução utilizando um único plasmídeo recombinante como controle positivo Estudo do transcriptoma de cepas de Mycobacterium tuberculosis em células gigantes multinucleadas ativadas por vitamina A e D utilizando sequenciamento total em alta perfomancede. Perfil transcriptômico comparativo de macrófagos em cultura, infectados com isolados clínicos de Mycobacterium tuberculosis com diferentes perfis de resistência a quimioterápicos Análise do transcriptoma total de Mycobacterium tuberculosis para determinação dos mecanismos de ação de novas drogas anti-TB Construção e avaliação do micobacteriófago D29 com expressão da proteína verde fluorescente para detecção rápida de bacilos da tuberculose pulmonar Participação da Chlamydia pneumoniae e Mycoplasma pneumoniae no Infarto agudo do miocárdio: possíveis mecanismos via CD14 e TLRs. Transcriptoma e proteoma em sangue periférico para pesquisa de novos marcadores de doenças cardiovasculares: estudo em infarto agudo do miocárdio Subclonagem, expressão e avaliação da atividade biológica do domínio extracelular da subunidade 2 receptor do interferon alfa Padronizacao da reacao em cadeia da polimerase (pcr) para o diagnostico de citomegalovirus (cmv) em pacientes portadores de hiv.
- Bolsas no Exterior - Em Andamento
- Bolsas no Exterior - Concluídas
Pesquisadores graduados pelo LBMAD de destaque
Profa. Dra. Sonia de Quateli Doi, MSc, MD, PhD
Research Associate Professor at Uniformed Services University of the Health Sciences-USUHS e Food and Drug Administration, Washington DC, USA.
Prof. Dr. Luis Salazar Navarrete
Professor Titular da Faculdade de Medicina da Universidade de Temuco, Chile.
Prof. Dr. Hemerson Bertazzoni
Ex-diretor Geral da Polícia Científica do Estado do Paraná, Perito Criminal e Professor Adjunto UNICURITIBA.
Prof. Dr. Tomás Zambrano
Professor Doutor da Universidade de Santiago do Chile, Chile.
Dr. Francisco Forestieto, PhD
Sênior Strategic Evidence Generation Manager at Novartis
Dra. Leticia Cecon, PhD
Director at IQVIA.
Dra. Maria Alice Willrich, PhD
Assistant Professor of laboratory medicine and pathology at Mayo Clinic, Rochester, MN, USA. Co-Director for the Protein and Antibody Immunology Laboratories and the Clinical Mass Spectrometry Laboratory at Mayo Clinic, Rochester MN, USA.
Dra. Selma Cristina Cavallir
Diretora da Divisão de Biosciences para América Latina na ThermoFisher
Dra. Rozangela Verlengia
Professora Doutora Faculdade de Ciências da Saúde Universidade Metodista de Piracicaba.
Profa. Dra. Alice Cristina Rodrigues, PhD
Professora associada do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo.
Prof. Dr. Álvaro Danilo Cerda
Prof. Dr. Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de Temuco Chile.
Dra. Patrícia Barco
Senior Director, Global Strategic Marketing at MaxCyte, Inc.
Profa. Dra. Rosilene Fressati Cardoso
Professora adjunta da Faculdade de Ciências Farmaceuticas da Universidade Estadual de Maringá.
Prof. Dr. Álvaro Largura
Ex-Professor da Universidade Estadual do Noroeste Cascavel Paraná. Diretor Presidente do Laboratório Biovel, Cascavel Paraná. CEO do Laboratório A3Q - Análises de Qualidade.
Profa. Dra. Maria Brion (pós doutora LBMAD)
Pesquisadora do Complexo Hospitalário da Universidade de Santiago de Compostela, Espanha.
Profa. Dra. Vivian Silbiger
Profa. Adjunta da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Prof. Dr. André Luchessi Ducati
Prof. Adjunto da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Prof. Dr. Jo Osugue
Prof. Titular da Universidade de Valência, Rio de Janeiro. Prof. Titular da Universidade de Volta Redonda, Rio de Janeiro.
Dra. Katlin Brauer Massirer
Pesquisadora C no CBMEG (Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética) - UNICAMP.
Prof. Dr. Lídio Lima Neto
Prof. Dr. da Universidade CEUMA, São Luís do Maranhão. Diretor do LACEN, São Luís do Maranhão.
Prof. Dr. Raimundo Antonio de Oliveira
Prof. Adjunto da Universidade Federal, São Luís do Maranhão.
Profa. Ana Messas
Professora Assistente da UNOESTE, Presidente Prudente, SP.
Dr. Maurício Pacheco de Andrade
Diretor Presidente - América Latina Testing Laboratório de Análises Clínicas Ltda - Foz do Iguaçu PR.
Dra. Hui Tzu Lin Wang
Inst. Dante Pazzanese de Cardiologia - Fundação Adib Jatene | Molecular Biology PhD.
Dra. Gisele Medeiros Bastos
Coordenadora de Pesquisa do Hospital BP - A Beneficência Portuguesa de São Paulo.
Dra. Lara Reinel de Castro
Coordenadora de Cardio-Oncologia do BP Mirante, Coordenadora de Práticas Médicas do BP Paulista, Cardiologista clínica do Corpo Clínico e membro do Núcleo de Cardiologia da BP.
Pesquisadores graduados pelo LBMAD
Pesquisadores que obtiveram títulos com a infraestrutura do LBMAD
- - Elisangela Marçal - 2022
- - Carolina Dagli - 2022
- - Larissa Nascimento - 2022
- - Thiago Augusto A. M. Cardoso - 2021
- - Carlos Gustavo dos Santos Silva - 2020
- - Cristina Moreno Fajardo - 2020
- - Bruna Los - 2019
- - Thais Kristini Almendros Afonso - 2019
- - Jéssica Bassani Borges - 2019
- - Aécio Assunção Braga - 2018
- - Veronica Simões de Oliveira - 2018
- - Magda Elizabeth G. Saldarriaga - 2017
- - Antony Brayan Campos Salazar - 2017
- - Marina Aparecida dos Santos - 2017
- - Juliana de Freitas Germano - 2016
- - Lara Reinel de Castro - 2015
- - Vivian Bonezi - 2015
- - Tomas Andres Zambrano Coloma - 2015
- - Aécio Assunção Braga - 2014
- - Juliana Gonçalves dos Santos - 2014
- - Gabriela Guimarães Sousa Leite - 2014
- - Hui Tzu Lin Wang - 2014
- - Adriana Bertolami Manfredi - 2014
- - Douglas Gomes Meneses S. Castro - 2014
- - Adriana Del Monaco De Maria - 2013
- - Gisele Medeiros Bastos - 2013
- - Silvia Tchernin Himelfarb - 2013
- - Elizandra Silva Guimarães - 2013
- - Tamiris Invencioni Moraes - 2013
- - Álvaro Danilo Cerda Maureira - 2013
- - Débora Cavichioli - 2012
- - Walkiria de Araújo Souza - 2012
- - Adriana Sasso Stuani - 2012
- - Patricia de Cássia Salgado - 2012
- - André Ducati Luchessi - 2011
- - Joás Lucas da Silva - 2011
- - Lídio Gonçalves Lima Neto - 2011
- - Fabiana Dalla Vecchia Genvigir - 2011
- - Maria Alice Vieira Willrich - 2011
- - Raquel de Oliveira - 2011
- - Fernanda Abujamra da Silva - 2010
- - Vivian Nogueira Silbiger - 2010
- - Carla Prisinzano Pastorelli - 2009
- - Letícia Cecon - 2009
- - Álvaro Danilo Cerda Maureira - 2009
- - Francisco José Forestiero - 2009
- - Jamile Couto - 2008
- - Milano Felipe dos Santos F. Marques - 2008
- - Renata Melo de Assis - 2008
- - Silvia Tchernin Himelfarb - 2008
- - Claudia Villazon Gonzales - 2008
- - Raquel de Oliveira - 2008
- - Alice Cristina Rodrigues - 2008
- - Simone Sorkin Arazi - 2008
- - Ana Cristina Messas - 2007
- - Lídio Gonçalves Lima Neto - 2007
- - Mauricio Pacheco de Andrade - 2007
- - Alvaro Largura - 2007
- - Evelyn Anzai Kanto - 2007
- - Paulo Henrique Lage Carbone - 2007
- - Fabiana Dalla Vecchia Genvigir - 2007
- - Érika Miguel de Souza - 2006
- - Maria Alice Vieira Willrich - 2006
- - Edward Jose de Oliveira - 2005
- - Mustafa Hassan Issa - 2005
- - Patricia Barco - 2004
- - Vladimir Tavares - 2004
- - Tânia Sueli de Andrade - 2004
- - Hamilton Massayuki Hinuy - 2004
- - Ivanise Marina Moretti Rebecchi - 2004
- - Bety Chen - 2003
- - Fabiana Cristina Pereira dos Santos - 2003
- - Rosilene Fressatti Cardoso - 2003
- - Sun Ok Yoon - 2003
- - Selma Andréa Cavalli - 2003
- - Heluih Ata Abdallah - 2002
- - Silverio Teixeira dos Santos - 2002
- - Elizabeth Cecilia Rodríguez Guzmán - 2002
- - Luis Antonio Salazar Navarrete - 2002
- - Marcos de Oliveira Machado - 2002
- - Tatsuya Sakuma - 2001
- - Cristina Strufaldi de Oliveira - 2000
- - Hemerson Bertassoni Alves - 2000
- - Regina Celia Paschoal - 2000
- - José Varga - 2000
- - Sonia de Quateli Doi - 2000
- - Andréa Luciana Araújo da Cunha - 2000
- - Katlin Brauer Massirer - 2000
- - Neuza Satomi Sato - 1999
- - Selma Andréa Cavalli - 1999
- - Sun Ok Yoon - 1998
- - Elizabeth Cecilia Rodríguez Guzmán - 1998
- - Luis Antonio Salazar Navarrete - 1998
- - Marcia Izumi Otta - 1997
- - Marcos de Oliveira Machado - 1997
- - Regina Mieko Sakata Mirandola - 1996
- - Segundo Moises Hernandez Abanto - 1996
- - Decio Sabbatini Barbosa - 1993
- - Fernanda Borges de Araujo - 1993
- - Edson Luiz da Silva - 1992
- - Marcia Izumi Otta - 1990
